雖然全球航空業受到疫情影響而曾經接近停頓，但運作仍在進行。卡塔爾航空公司宣佈，與聯合國難民署（UNHCR）達成為期兩年的合作夥伴協議，共同為全球流離失所者提供人道主義救濟與援助。作為兩家機構之間的首次戰略合作，卡塔爾航空將在當前史無前例的大環境之下擔當航空物流承運商的角色，為全球有需要的地區提供關鍵救援物資的航空物流運輸。
上述協議於2020年5月19日在卡塔爾首都多哈簽署，標誌著卡塔爾航空與聯合國難民署之間達成了加強團結、凝聚共識的策略基礎，以便更有效地應對新冠肺炎疫情大流行帶來的種種挑戰。此項合作協定將持續至2022年5月，聯合國難民署將在協議期間與卡塔爾航空互相合作，充分利用多哈哈馬國際機場的樞紐航線網絡優勢，並在卡塔爾航空200多架飛機機隊規模的支援下，高效運送包括飲用水、醫療和衛生用品在內的各類救援物資，為世界各地的難民、國內流離失所者和收容社區成員提供安全保障。
卡塔爾航空集團行政總裁Akbar Al Baker先生在談到合作協定時表示：「我們對此次能攜手聯合國難民署，共同為急需救援的社區提供援助感到非常自豪。卡塔爾航空擁有完善的國際航線網絡，可為聯合國難民署的人道主義工作提供強而有力的支援。在疫情期間，我們緊密配合各國政府及非政府組織，優先運送超過17.5萬噸醫療和救援物資，總量相當於1,750架載滿貨物的波音777貨機。我們致力通過加深合作、齊心協力的方式來貢獻自己的一份力量，以堅強、團結和不屈的精神來回應當前面臨的挑戰。」
聯合國難民署駐海灣阿拉伯國家合作委員會（GCC）成員國高級顧問兼代表哈立德·哈利法（Khaled Khalifa），在談及當前的形勢挑戰時表示：「新冠肺炎疫情仍然深刻地影響著世界各國，我們從未思考過疫情所帶來的後果究竟有多大，又會涉及多少生命。聯合國難民署的首要任務是保障社會邊緣化群體和弱勢人士的權利和福祉。在當下的危機中，我們必須通過實際行動來尋求長久的解決方案；這亦是我們與卡塔爾航空的合作夥伴關係如此重要的原因。難民們往往由於缺乏充足水源、衛生系統和醫療設施，而導致他們處於危險的環境之中。因此，我們決定與卡塔爾航空這家備受讚譽的航空公司進行合作，攜手制定關鍵政策，一同應對外部環境帶來的挑戰。我們必須採取行動，攜手共進。」
卡塔爾航空貨運以多哈哈馬國際機場為基地，航線網絡覆蓋非洲、亞洲、歐洲、美洲和大洋洲的多個國際目的地，可充分支援聯合國難民署在世界各地的救援任務。在協議的框架下，卡塔爾航空貨運將為重達400噸的基礎物資提供航空運輸服務，將物資高效運送至聯合國難民署遍佈全球的分支機搆。
卡塔爾航空在疫情期間大幅提升了貨運運力，以支援世界物流網絡的營運與開放，為受影響的地區運送應急抗疫物資。卡塔爾航空貨運目前繼續執行大量貨運航班計劃，每日營運的貨運航班達到180架次。在全貨運航班的基礎上，卡塔爾航空貨運還利用客機腹艙運輸，執行大批「客改貨」航班和特殊貨運包機任務，維持全球重要供應鏈的暢通。卡塔爾航空目前執行飛往多個國家的貨運包機航班，其中包括中國、印度、伊朗、科威特、黎巴嫩、法國、西班牙、意大利、比利時、德國、波蘭、英國、美國和澳洲等。卡塔爾航空的全貨運機隊包括兩架波音747-8貨機、21架波音777貨機和五架空中巴士A330貨機。